Un altro aspetto che rende Linux particolarmente interessante riguarda le applicazioni. Ormai, difatti, gli applicativi sviluppati per Linux sono moltissimi, di elevata qualità e consentono a qualsiasi tipo d'utente di disporre di software adeguato alle proprie esigenze, capace di competere con i propri concorrenti commerciali e, soprattutto, in grado di produrre documenti nei formati standard. Il caso tipico è quello di OpenOffice (o del suo derivato LibreOffice), la celebre suite per la produttività d'ufficio che consente di gestire qualsiasi tipo di documento Office nei diversi formati.

In molti casi, poi, i software open source sono diventati essi stessi dei riferimenti per la qualità ed il loro successo è stato tale che oramai vengono rilasciati in formati differenti per poter girare su qualsiasi tipo di piattaforma: si pensi, ad esempio a Firefox, accreditato come uno dei migliori browser per la navigazione in Internet, o a Thunderbird, in cima alla classifica dei client di posta, o ancora, a Filezilla, riferimento per il client FTP.

Si consideri, inoltre, che anche molti software proprietari sono ormai disponibili anche per Linux. É, ad esempio, il caso di Skype, il celeberrimo, software per telefonia VOIP o di componenti come Flash Player e Java, indispensabili per la visualizzazione di contenuti multimediali in internet.

Un elenco completo di tutto il software disponibile per Linux fuoriesce dagli intenti di questa discussione. In questa sede, al fine di evidenziare come ogni ambito sia supportato da sw di qualità, ci limiteremo solamente a ricordare applicazioni come Eclipse per lo sviluppo sw, Banshee fra i riproduttori audio, OpenShot o PiViTi fra i video editor, Gimp per il fotoritocco, Pidgin per la messaggistica istantanea.